Tệp đầu ra giải trình tự

Một phần của tài liệu nextseq-1000-2000-sequencing-system-guide-1000000109376-vie (Trang 73 - 74)

Loại tệpMơ tả, vị trí và tên tệp

Tệp phát hiện base liên kết

Mỗi cụm được phân tích sẽ có trong một tệp phát hiện base liên kết, được tổng hợp thành một tệp cho mỗi chu kỳ, làn và bề mặt. Tệp tổng hợp chứa phát hiện base liên kết và điểm chất lượng được mã hóa cho mỗi cụm. Tệp phát hiện base liên kết được BaseSpace Sequence Hub hoặc bcl2fastq2 sử dụng.

Data/Intensities/BaseCalls/L001/C1.1 L[lane]_[surface].cbcl, ví dụ nhưL001_1.cbcl

Tệp vị trí cụm Đối với mỗi tế bào dịng chảy, một tệp vị trí cụm nhị phân có chứa các tọa độ XY cho các cụm trong một ơ. Bố cục hình lục giác khớp với cách bố trí giếng nano của tế bào dòng chảy xác định trước tọa độ.

Data/Intensities s_[lane].locs

Tệp bộ lọc Tệp bộ lọc chỉ định xem một cụm có đi qua bộ lọc hay không. Các tệp bộ lọc được tạo ở chu kỳ 26 bằng 25 chu kỳ dữ liệu. Đối với mỗi ô, hệ thống sẽ tạo một tệp bộ lọc.

Data/Intensities/BaseCalls/L001 s_[lane]_[tile].filter

Tài liệu số 1000000109376 v05 VIE

Chỉ dùng cho mục đích nghiên cứu. Khơng dùng trong các quy trình chẩn đốn.

Loại tệpMơ tả, vị trí và tên tệp

Tệp InterOp Bạn có thể xem các tệp báo cáo nhị phân trên thiết bị bằng Phần mềm điều khiển thiết bị hoặc ngoài thiết bị trong SAV hoặc BaseSpace Sequence Hub. Các tệp InterOp được cập nhật trong suốt q trình chạy.

Thư mụcInterOp

Tệp thơng tin lần chạy

Liệt kê tên lần chạy, số chu kỳ trong mỗi đoạn đọc, đoạn đọc có phải là Đoạn đọc chỉ thị hay khơng và số lượng các dải và ơ trên tế bào dịng chảy. Tệp thông tin lần chạy được tạo ở đầu lần chạy.

[Root folder],RunInfo.xml

Một phần của tài liệu nextseq-1000-2000-sequencing-system-guide-1000000109376-vie (Trang 73 - 74)

Tải bản đầy đủ (PDF)

(119 trang)